Der Einsatz von APS-Systemen dient hauptsächlich dazu durch eine optimale Auftragsreihenfolgeplanung die Durchlaufzeiten zu minimieren. In ERP-Systemen wird die Durchlaufzeit als gemittelte statistische Größe zur Ermittlung der Kundenliefertermine sowie der Start- und Endezeiten von Produktionsaufträgen verwendet. Sie ist Planunggröße.

Die Durchlaufzeit ist jedoch das Ergebnis guter Planung. Wenn es gelingt, Aufträge reibungslos durch die Produktion zu schleusen sinken automatisch die Liege- und Übergangszeiten und damit die Durchlaufzeit. APS-Systeme werden genau zu diesem Zweck verwendet.